武汉有很多到南京的旅游团，如武汉到南京、杭州、苏州、上海西溪湿地超值双飞5天游（湖北徐东国际旅行社有限公司南湖门市部，¥1250起），武汉到南京、苏杭、乌镇、周庄动车三日游（湖北九州国际旅行社有限责任公司，¥999起），武汉至南京动车五日游（湖北九州国际旅行社有限责任公司，¥1250起）等，可以考虑参团。自助游的话武汉前往南京共四次列车，耗时约9小时，硬座83.0元，硬卧159.0元。
南京建议游览的景点有中山陵、夫子庙、南京总统府、秦淮河、南京长江大桥、紫金山天文台、明孝陵、雨花台、玄武湖、南京博物馆、栖霞山、紫金山、莫愁湖、栖霞寺、灵谷寺、梅花山、秦淮河画舫、中华门、紫霞湖、阅江楼。燕子矶等。
夫子庙秦淮河区域的住宿比较热门，这里有南京最有名的夫子庙国际青旅。还可以选择新街口、南大南师附近、鼓楼附近等地住宿，这些地方离总统府、朝天宫、玄武湖以及1912酒吧街等比较近。