明尼苏达州是一个非常重要的交通地区，沿密西西比河及五大湖-圣劳伦斯海路共有15个港口，许多物品从德卢斯内陆港沿密西西比河运入运出，年均货物吞吐量4千万吨。州府圣保罗是其中重要的港口。