越西虫草子座多分支或者单生，细长而坚硬，直立而曲折，由寄主口部伸出，高20—30厘米，粗1.5—2.5毫米.头部圆柱状或棒状，褐色，黑褐色，顶端有延长的不育性尾部，粗2—2.3毫米，具假薄壁组织的皮层.子囊壳椭圆形或者卵圆形，400—740*300—450微米，黑褐色，表面生，凸生，成天南星果序列.子囊圆柱形，260—480*8—12微米.子囊孢子透明或微黄色，线状，蠕虫状，多横隔，160—350*2.5—3.5微米，成断裂状，断裂后的孢子小段约10—20*2.5—3.5微米.子囊壳下的壳柄多分枝，新鲜时褐黄色或者黄秆色，偶也成细长的单一直立枝.寄主体内菌丝新鲜时淡乳白色.