梅里达地区的众多海域之下隐藏着古老的海底岩洞和深达几十米的狭窄通道，只有能够进行洞穴探险的潜水老手才能够知道自己的设备是否合适。 在众多适合洞穴潜水的岩穴中，最著名的要数希拉卡赫（Xlacah）、堪布尔（Kambul）、布龙乔霍尔（Bolonchoojol）、切伦敦（Chelentún）、查科新尼克切（Chak-Zinik-Che ）和圣伊格纳西奥（San Ignacio）。这些岩洞都深达六米多，洞穴配备有人工灯光和配合环境的音乐，为潜水营造出良好的氛围。 阿拉克拉内斯（el  Arrecife Alacranes ）珊瑚礁距离进步港（Puerto Progreso）130公里，珊瑚礁上共同生长着20多种珊瑚虫。阿拉克拉内斯珊瑚礁是由三处小岛组成的，分别是：流放岛（Isla Desterrada），背叛者岛（Isla Desertora）和飞鸟岛（Isla Pájaros）。除此之外，女孩岛和佩雷斯岛也是潜水的好去处。佩雷斯岛是其中唯一有人居住的岛屿，岛上居住着海军部的人，保卫着海岛的自然环境。1994年，阿拉克拉内斯珊瑚礁被列为了国家海上公园。