克孜尔千佛洞的洞窟形制大致有两种：一种为僧房，是供僧徒居住合作产的场所，室内有灶炕和简单的生活设施 ;另一种为佛殿，是供佛徒礼拜和讲经说法的地方。克孜尔千佛洞集中了较多的佛教本生和姻缘的故事，每个菱形格都讲述了一个佛教故事，它是佛教从西向东传播过程的体现，是研究佛教历史的信息源。洞室中已经绘有姿态飘逸的飞天形象，画上的这把王弦曲琵琶，是从波斯传入然后传到了日本，被日本列为国宝。