洪河自然保护区作为一个自然保护区，因为完善的保护措施，保护区内的植被至今仍保持其原始状态，整个保护区以草本沼泽植被和水生植被为主，中间还有岛状林分布。保护区内有着野大豆、水曲柳、核桃楸、黄菠萝、刺五加和黄芪等6种国家珍稀濒危野生植物。同时在岛状林中还有杨、桦、柞、椴树等多种重要的经济树种。