出境时携带1万欧元、12万代纳尔以内现金不需要申报；携带超过1万欧元必须申报并提供入境时海关出具的证明；禁止携带超过12万代纳尔的现金。
动物及宠物入境或出境均需提供相关证明材料（出境国出具的健康证明，宠物护照，携带禽类还需出具世界动物卫生组织成员国的证明），海关将在上述证明材料齐全的情况下，确认宠物不是用于交易，进行动物检疫和健康检查后，出具动物准入证（VED）并予准入。
法律禁止携带任何假冒伪劣和盗版产品入出境，此类产品一经确认，将被没收并销毁。
法律禁止携带任何濒危动植物及其制成品如象牙、犀牛角等入出境。
各类历史文物原件出境时均需特别许可。
马其顿海关允许个人入境时携带200支香烟（或100支小雪茄，或50支雪茄，或250克烟叶或适量其他类烟草制品），2升葡萄酒和1升烈性酒（或2升非 烈性酒），50毫升香水和250毫升淡香水。携带非商业用途的商品或物品如金额不超过350欧元可不申报，但烟草酒水香水类产品需同时不能超过350欧元 且不能超过上述数量限制。外国人每人可携带入境1万欧元或12万代纳尔，超过须申报。对于药品、武器、动植物、蔬菜及种子类物品，必须申报，海关会查验相 关发票证件等。
马其顿海关隶属马财政部，总部位于首都斯科普里，分别在库马诺沃（Kumanovo）、斯蒂普（Stip）、盖夫盖利亚（Gevgelija）、比托拉（Bitola）设有办事处。
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